Jesrad

On m'a subtilement fait comprendre que ce sujet intéressait du monde ici Je vais vous présenter l'expérience que j'en ai eu, ce qui est possible actuellement, les limitations à prendre en compte, et quelques outils fort pratiques. Il y a trois grands fournisseurs de séquençage "grand public" générique aujourd'hui, tous aux USA. Le plus connu, pionnier du domaine et racheté récemment par Google c'est 23andme ; on trouve aussi le projet Genographic initié par le groupe média National Geographic ; et enfin le dernier arrivé FamilyTreeDNA et son service Web grand public FamilyFinder ainsi que leur partenaire Ancestry.com. (il y a aussi des fournisseurs de tests génétiques plus ciblés s'adressant aussi au grand public, comme Pathways Genetics mais ils ne font pas dans le séquençage "large") Chacun a une orientation spécifique: 23andme vise le séquençage à fins médicales générales, FamilyFinder comme son nom l'indique pour retrouver ses origines immédiates (enfants illégitimes ou adoptés, réfugiés / déportés et migrants), et Genographic s'intéresserait plus aux origines ancestrales. Cette distinction est importante: pour des raisons de coût et de rapidité chaque boîte a mis au point sa propre puce de séquençage (23andme) ou utilise un modèle "industriel" spécifique (les autres) et du coup ils ne testent pas les mêmes bases. Pour simplifier, ce qui est lu ce sont des emplacements spécifiques de certaines bases uniques dont on sait qu'elles varient entre les individus, contrairement aux 99,9% restant de l'ADN humain. Chacun de ces emplacements ou bases est un "SNP" ('snip') pour Single Nucleotide Polymorph(ism). Donc on n'obtient pas au final une longue liste de ATCG représentant son ADN du début à la fin, mais une litanie de lignes de type "emplacement génétique - numéro de chromosome - bases relevées sur chaque exemplaire": ... rs3737717 1 1242084 AA i6054370 1 1246013 GG i6019334 1 1248166 CC i6019335 1 1248974 TT ...On connaît aujourd'hui environ un million de ces bases variantes, on estime qu'il y en aurait en tout dans les 2 millions et quelques, on devrait les connaître toutes d'ici 2050, mais en attendant chaque compagnie se concentre sur 500 à 600 000 SNPs parmi les mieux connus et variant moins rarement. La lecture n'est pas totalement garantie: comme les puces ne sont pas 100% parfaites, environ 0,1% des SNPs ne parviennent pas à être lus et portent un résultat vide, et entre une grosse dizaine à une petit centaine de SNPs par génome sont erronés. 23andme s'engage à rapporter au minimum 99,9% des SNPs qu'il analysent mais omettent de préciser ce dernier détail...Je n'ai pas trop regardé mais il me semble que les prix sont comparables entre les trois. Les frais de port sont conséquents parce qu'un échantillon vivant d'ADN ça ne se conserve pas longtemps et que c'est expédié à l'international. D'ailleurs il y a quelques pays qui interdisent carrément ce genre d'envoi, comme la Russie ou le Vénézuéla. Mais on peut truander en se faiant expédier le kit dans un pays voisin grâce à un réexpéditeur commercial, et en mentant lors de l'envoi en retour de l'échantillon. Dans mon cas j'ai fait appel à 23andme. Leurr kit arrive dans une grande pochette (dans mon cas DHL, pour la France et probablement le reste de l'Europe), avec une seconde pochette pour le retour, et perdu dedans: une petite boîte contenant le tube d'échantillonnage et les explications (en anglais uniquement). Il faut enregistrer un compte associé au numéro figurant sur le kit. La plus grosse contrainte pour le test c'est l'envoi en retour, donc il faut soit habiter juste à côté d'un centre DHL Express (et pas un centre DHL ordinaire, attention !), soit organiser un enlèvement. Il faut n'avoir rien mangé depuis au moins 30 minutes avant de remplir le tube. Il y a la place pour au moins 3 ou 4 échantillons dans la pochette de retour (de mémoire elle est prépayée pour 500 grammes), donc on peut économiser pas mal en faisant plusieurs tests d'un coup. Le kit met 48h à arriver au labo, ensuite il faut 3 à 6 semaines pour les résultats. Dès l'enregistrement du compte on peut participer aux études de recherche génétique en répondant à une demi-chiée de questionnaires de santé (il y a de tout: dépression, arthrite, Parkinson, cancer, droitier-ou-gaucher, bronzage, etc.). Comme la FDA (autorité sanitaire fédérale US) a brutalement interdit à 23andme de fournir des informations générales de santé à ses clients (alors qu'ils reçoivent des grants du NIH, paie ta cohérence étatique...), ils se sont précipitamment respécialisés en origine ancestrale et généalogique, donc il y a aussi des pages pour renseigner son arbre généalogique (soit manuellement soit par import d'un fichier GEDCOM, qu'on peut par exemple exporter à partir de geneanet) - le kit comprend d'ailleurs un abonnement limité à myheritage.com de 6 mois mais qui n'apporte franchement rien d'utile (quasiment toutes les fonctions restent payantes). Mieux vaut s'inscrire sur geneanet et transférer les données par fichier GEDCOM. Ce qui est bien: 23andme a plus de 800 000 ADNs en banque, leur fonction de recherche de cousins distants est très efficace et précise (on peut exporter toutes les correspondances en CSV) donc il y a de quoi s'occuper. Ce qui est moins bien: les fonctions "pays d'origine" et haplotypes (caractérisation patrilinéale et matrilinéale par le chromosome Y et l'ADN mitochondrial) sont inexactes voire carrément fausses. Les origines non-européennes sont largement sous-estimées, par exemple. Le typage du Y s'arrête à M418 pour la branche R1, et pour toutes les branches certaines variantes récemment identifiées (=depuis 2013, en gros) sont simplement manquantes (c'était le cas pour mon ADNmt ET pour mon ADN-Y). Pour préciser sur l'origine ethnique: 23andme mesure la composition ethnique à partir d'échantillons en très petites quantitiés (1 seul échantillon pour certaines populations "de référence" ! Moins de 10 pour la majorité !) et surtout ils sont pris dans des populations modernes. C'est, disons, plutôt débile... Heureusement il y a des outils disponibles sur l'Internet, qui sont utilisés en anthropologie génétique, que l'on peut utiliser pour améliorer largement ces résultats: Interpretome - outil qui s'exécute localement (en javascript?), donc qui ne dévoile pas votre génome à un tiers. Il permet de faire de nombreuses analyses et confronter son ADN à des références mondiales, régionales et ancestrales (on a pas mal d'échantillons d'ADN humain d'il y a 3000, 6000, 15 000, 50 000 ans...) GEDmatch - service gratuit d'analyse ancestrale mais donc assez "cheap" qui permet de faire les mêmes analyses, en plus de proposer de rechercher des similarités génétiques parmi les autres membres (j'ai pas encore pu tester ça, le traitement est très long faute de moyens) Promethease - service payant (5$) pour sortir un compte-rendu complet d'informations de santé (comparable à ce que fournissait 23andme initialement), en utilisant les données de SNPedia qui rassemble les mutations connues de la littérature médicale. Du coup il y a baucoup de foutaise dans le rapport (les chercheurs adorent supposer des liens statistiques faibles entre gènes et phénotype voire entre gène et comportement... il faut bien gratter un financement, hein), mais les mutations les plus significatives sont spécialement soulignées.

Il y a un cercle de l'Enfer réservé aux conseillers d'orientation et aux "bibliothécaires" de CDI de collège et lycée.

1/10 suis-je encore digne ? :/

Il m'a semblé lire que l'acier contenait trop d'impuretés soufrées et était de ce fait trop cassant à basse température.

Tu confonds avec l'italien

L'espagnol, ce serait fort pratique.

S'ils leur parlent en mandarin, oui, ce serait comme s'étonner qu'un blanc européen ne comprend pas le français et te réponde en flamand ou en polonais.

Un régime au minimum, et avec son entourage végétalien, ça doit pas être le seul changement.

J'y repense: à part écouter moins de musique, mon frère remplit tous les critères depuis qu'il a rejoint une association transgenre pour faire sa transition...

"Marie" c'est le troisième prénom de mon père, de fait. Mais va trouver un mec qui s'appelle "Sainte-Marie" pour voir. Son seul prénom, hein.

Mon arrière(x4)-grand-père se prénommait Sainte-Marie. True story.

Mitigé. Depuis que je sus Liborg, j'écoute plus de musique, j'ai repris les formations de toute sorte et je reprends contact avec des gens de ma famille.

T'as bien l'âge de t'appeler Camille.

D'après les gens sur place, 8 cm de neige.

Le braqueur meurt en balbutiant "Je croyais qu'on pouvait pas avoir de flingue dans le New Jersey".

En 2019 les résultats des élections feront sauter l'accord quand même. La politique c'est et ça restera des chaises musicales.

Pourquoi à la majorité ? L'usage fait le droit, en la matière. Non ?

C'est pas un argument, c'est une opinion. Débile, de surcroît.

La réalité est une expérience purement subjective.

Ah, les vieux délires Völkisch. Quand on explique à leurs partisans que c'est le fondement du nazisme, ils buggent.

Le roi Abdallah des Saoudis est mort cette nuit. Popcorn time (et gilet pare-balles).

Que les chiffres avancés sot faux. On en a déjà parlé sur ce fil, les stats officielles disent exactement le contraire.

Oui, d'où l'importance d'être bien vacciné.

Bob Lennon et tous les critiques américains gays de film.

Tu sais, personne n'aurait imaginé qu'ils castent un gay notoire (Jonathan Groff) non plus.