Coronavirus : publications scientifiques, cartes, statistiques, essais cliniques etc.

[Rübezahl]

on connaît donc le prochain médoc en pénurie. Merci.

[h16]

Pendant ce temps, l'AMA (american medical assoc) publie ceci : 

 

 

https://www.ama-assn.org/system/files/2020-10/nov20-handbook-addendum.pdf 

[ttoinou]

il y a 51 minutes, h16 a dit :

Pendant ce temps, l'AMA (american medical assoc) publie ceci : 

 

 

 

https://www.ama-assn.org/system/files/2020-10/nov20-handbook-addendum.pdf 

 

 

https://www.publishedreporter.com/2020/12/11/american-medical-association-rescinds-previous-statement-against-prescription-of-hydroxychloroquine-to-covid-19-patients/

 

Citation

UPDATE/CORRECTION DECEMBER 14 2020: This article was corrected. A previous version of this story did not include the meeting results for either ADOPTION or NON-ADOPTION of the resolution. This RESOLUTION was included with many others presented at a Special Meeting of the AMA in November 2020. RESOLUTIONS are generated by AMA delegates/delegations, the AMA Board of Trustees, AMA Councils and AMA Sections. The RESOLUTION must be accepted and this resolution was not accepted. The RESOLUTION was reaffirmed.

 

Du coup j'comprends rien

[h16]

il y a 39 minutes, ttoinou a dit :

"The RESOLUTION must be accepted and this resolution was not accepted. The RESOLUTION was reaffirmed."

Heu. Donc ils sont ok ? 

[Antoninov]

Oui oui je suis d'accord avec tout ca.

L'aspects anticoagulant / plaquettes est exactement le point discuté.

(mais comme indiqué dans l'article, ils n'ont pas intégré les autres médicaments dans l'analyse, donc si bcp parmis ces patients prenaient d'autres medicaments en combinaison avec l'aspirine, pour par exemple d'autres problèmes, il y a peut-etre un autre facteur/medicament qui a joué).

 

[ttoinou]

il y a 30 minutes, h16 a dit :

Heu. Donc ils sont ok ? 

Et ça veut dire quoi "this resolution was not accepted" ? Pourquoi il y a "resolution" et "RESOLUTION" ? J'ai l'impression d'être illettré 

[h16]

il y a 54 minutes, ttoinou a dit :

Et ça veut dire quoi "this resolution was not accepted" ? Pourquoi il y a "resolution" et "RESOLUTION" ? J'ai l'impression d'être illettré 

La typo n'a pas d'importance. En gros ils disent "on n'a pas accepté, on a simplement réaffirmé notre résolution" (qui disait qu'on était ok pour l'HCQ).

[Tramp]

Ils ont dit qu’ils étaient ok pour qu’un médecin prescrive en dehors des recommandations FDA. C’est pas la même chose que ok HCQ

[Mathieu_D]

Sinon les premières évaluations des confinements français sont sorties. (Rappelez vous en septembre-octobre il y avait plusieurs zones avec ou sans restrictions donc on peut faire des comparaisons.)

https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.50.2001974

 

TLPL verdict : c'est pas net, mais ça aurait un peu marché.

 

[Lancelot]

Quelque part c'est un soulagement si tout ça n'a pas été complètement sans effet. Je m'attends à ce que la recherche sur le sujet soit peu conclusive cependant. Le meilleur cas serait qu'il y ait un effet indéniable mais trop petit pour que quiconque puisse estimer que ça vaille le coup.

[Liber Pater]

Il y a 2 heures, Mathieu_D a dit :

Sinon les premières évaluations des confinements français sont sorties. (Rappelez vous en septembre-octobre il y avait plusieurs zones avec ou sans restrictions donc on peut faire des comparaisons.)

https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.50.2001974

 

TLPL verdict : c'est pas net, mais ça aurait un peu marché.

 

Ben si on regarde les courbes, c'est pas très concluant. Et ils parlent eux-mêmes d'effet de résonnance qu'ils n'ont pas étudier, donc ic tout n'est que supposition. En plus, les effets des catégories 2 et 3 commencent avant les premières mesures... qui n'y ont pas été appliquées

[GilliB]

Je n'ai rien lu de probant dans leur démonstration. D'ailleurs ils parlent de l'effet des vacances scolaires (dans mon expérience personnelle c'est plutôt un accélérateur de dissémination par brassage familial), et du troisième groupe qui a vu les admissions baissées plus tôt.

 

 

[GilliB]

ils en parlent dans le dernier BEH

http://beh.santepubliquefrance.fr/beh/2020/38/pdf/2020_38.pdf

en français.

 

Mais pourquoi pas. Le couvre feu touche les soirées dans les bars qui sont des clusters actifs. Le premier cluster sont les établissements de soins.. On n'a qu'à les fermer..

[Mathieu_D]

En tout cas c'est sûr que s'ils trouvent un effet positif ils se gardent bien de le quantifier.

C'est pas net net à dire le moins.

[L'affreux]

Il vaut mieux confiner, même s'il ne se passe rien, que risquer qu'il se passe quelque chose de pire en ne confinant pas. 

[fm06]

 

De gauche à droite: Macron Castex, Véran, Salomon.  On les reconnait bien.

 

 

[Freezbee]

Fil intéressant sur la dernière variante britannique :

 

 

Lien vers le compte-rendu : NERVTAG meeting on SARS-CoV-2 variant under investigation VUI-202012/01

 

Citation

NERVTAG meeting on SARS-CoV-2 variant under investigation VUI-202012/01

 

Date & Location of meeting: 11:00 – 13.00 18 December 2020 - Via telecon only

 

Brief summary of NERVTAG opinion-signed off by Chair.

 

• The committee received and considered three documents:

1. The PHE document ‘New evidence on VUI-202012/01 dated 18 December
2. Ct monitoring data from ONS/Oxford University COVID-19 Infection Survey
3. Bonsall paper: Early analysis of a potential link between viral load and the N501Y mutation in the SARS-CoV-2 spike protein

 

• Four analytic approaches were reviewed regarding the transmissibility of VUI-202012/01

1. Growth rate from genomic data: which suggest a growth rate of VUI-202012/01 that that is 71% (95%CI: 67%-75%) higher than other variants.
2. Studies of correlation between R-values and detection of the variant: which suggest an absolute increase in the R-value of between 0.39 to 0.93.
3. PCR ct values: which suggest a decrease of ct value of around 2 associated with the new variant.
4. Viral load inferred from number of unique genome reads: which suggests 0.5 increase in median log10 inferred viral load in Y501 versus N501.

 

• It was noted that variations in observed ct values can change with epidemiology since the stage of illness at which infection is detected can vary with incidence of cases, awareness of transmission, and the availability of tests.

 

• It was noted that VUI-202012/01can be challenging to sequence so estimates of frequency of this variant may be underestimates.

 

• It was noted that whilst previous variants have successfully emerged in periods of low prevalence without clear evidence of having a selective advantage, the emergence and subsequent dominance ofVUI-202012/01 in a period of relatively high prevalence suggests VUI-202012/01 does have a selective advantage over other variants.

 

• It was noted that VUI-202012/01has demonstrated exponential growth during a period when national lockdown measures were in place.

 

• In summary, NERVTAG has moderate confidence that VUI-202012/01 demonstrates a substantial increase in transmissibility compared to other variants.

 

• NERVTAG concluded that there are currently insufficient data to draw any conclusion on:

1. Underlying mechanism of increased transmissibility (e.g. increased viral load, tissue distribution of virus replication, serial interval etc)
2. The age distribution of cases
3. Disease severity: 4 deaths in around 1000 cases have been identified but further work is needed to compare this fatality rate with comparable data sets.
4. Antigenic escape. The location of the mutations in the receptor binding domain of the spike glycoprotein raises the possibility that this variant is antigenically distinct from prior variants. Four probable reinfections have been identified amongst 915 subjects with this variant but further work is needed to compare this reinfection rate with comparable data sets.

 

• The committee discussed the geographic extentof spread of the variant:

1. Within the UK, the variant is concentrated in the London, South East and East of England but has been detected in various parts of the UK.
2. Few cases of this variant have been reported internationally but one confirmed export from the UK to Australia has been reported. It was noted that other countries have lower sequencing capability than the UK.

 

• NERVTAG endorsed theactions proposed by PHE and in addition noted that:

1. Better comparative data on reinfection, readmission and case fatality rates will be available next week.
2. Better data on the age distribution of infections with this variant will be available next week.
3. In vitro data on the ability of convalescent and post-immunisation sera to neutralisethis variant will take at least a further week.

 

• Work is ongoing to evaluate the ability of Lateral Flow Devices to detect VUI-202012/01.

 

• NERVTAG recommends that ajoint NERVTAG-SPI-Msubgroup of SAGE is convened to provide further advice on risk and risk mitigation measuresfor VUI-202012/01.

 

[Mégille]

il y a une heure, Freezbee a dit :

Bonsall paper: Early analysis of a potential link between viral load and the N501Y mutation in the SARS-CoV-2 spike protein

Wait, c'est pas celle du vaccin, celle-là ? 

[Freezbee]

Il y a 13 heures, Mégille a dit :

Wait, c'est pas celle du vaccin, celle-là ? 

 

Il y a un article wikipedia sur la variante mis à jour très régulièrement. D'après ce dernier :

 

Citation

Vaccine effectiveness

 

As of late 2020 several COVID-19 vaccines were being deployed or under development. While the new variant has mutations to the spike glycoprotein targeted by the three leading vaccines, the immune system produces antibodies to several regions of the protein in response to the vaccine, so it is thought to be unlikely that a single mutation would make the vaccines less effective.

 

However, as more mutations occur, the vaccines may need to be altered. SARS-CoV-2 does not mutate as quickly as influenza viruses, and the new vaccines that had proved effective by the end of 2020 are types that can be adjusted if necessary. As of the end of 2020, German, British, and American health authorities and experts believe that existing vaccines will be as effective against the new VUI – 202012/01 strain as against previous strains.

 

As of 20 December 2020 Public Health England confirmed there is "no evidence" to suggest that the new strain would be resistant to the Pfizer–BioNTech vaccine currently being used in the UK's vaccination programme, and that people should still be protected.

 

[Lancelot]

Attendez, j'ai mieux comme histoire : la mutation est originaire du Royaume-Uni, pays qui est pionnier dans la vaccination. Elle touche la protéine ciblée par les vaccins. Ergo, le vaccin a créé la mutation

[Vilfredo]

Citation

Preprint sur la saisonnalité (qui trouve des corrélations sur la température et l’humidité par rapport au taux de reproduction de base). Les graphiques à différentes échelles peuvent intéresser certains https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.12.16.20248310v1.full.pdf+html

Citation

Strong disease responses are identified between 12-18°C for Temperature and 4-12 g/m³ for Absolute Humidity. These results classify COVID-19 as a seasonal low-temperature infection, and point to the airborne pathway as an important contribution to transmission for SARS-CoV-2, with implications for control measures we discuss.

 

Citation

To address whether the negative relationship with both T and

AH is merely the result of a coincident timing between trends

in epidemic spread and wintertime conditions in temperate regions, we analysed the evolution of the disease-climate associations locally in time and at several disaggregated spatial scales for groups of countries in all five continents (Fig.2). To this end, we relied on a statistical method, Scale-Dependent Correlation Analysis or SDC, specifically developed to identify similar patterns of variation by means of local or transitory (linear) correlations between two time series given a moving window of time (Methods, and (18–20)).

Application of this analysis to other diseases known to be

climate sensitive has successfully shown that (linear) associations can be discontinuous in time, alternating temporal intervals with high significant correlations and those with low

or non-existent ones(21,

22). Such transient coupling can be expected in the response of nonlinear systems to an external

driver, especially when the functions relating particular pa-

rameters to the driver are themselves nonlinear, so that effects are more evident in particular ranges of the forcing variable. SDC is essentially a pattern-recognition tool which allows one to consider the scale over which to evaluate correlations, as the window size can be systematically varied to focus for example on increasingly local patterns of variation.

@Mathieu_D @Lancelot 

[Rolanddezar]

Pour rappel, il y a 8 millions d'obèses en France.

[Vilfredo]

Il y a un train qui va de Paris à Vladivostok.

[ttoinou]

il y a 1 minute, Vilfredo Pareto a dit :

Il y a un train qui va de Paris à Vladivostok.

Autre que le fameux transsibérien ?

[Vilfredo]

à l’instant, ttoinou a dit :

Autre que le fameux transsibérien ?

Non celui-là même enfin je crois. Je cherchais simplement un énoncé vrai bien que sans lien apparent avec le sujet pour participer au jeu.

[Tramp]

il y a 12 minutes, Vilfredo Pareto a dit :

Il y a un train qui va de Paris à Vladivostok.

Il y a nécessairement un changement de train à cause de l’écartement des rails. 

[Mathieu_D]

8 minutes ago, Vilfredo Pareto said:

Non celui-là même enfin je crois. Je cherchais simplement un énoncé vrai bien que sans lien apparent avec le sujet pour participer au jeu.

Le rapport c'est que les morts ou même les très atteints par le Corona le méritent car ils ont une mauvaise hygiène de vie où sont trop vieux.

( /S , hein)

[ttoinou]

il y a 10 minutes, Vilfredo Pareto a dit :

Non celui-là même enfin je crois. Je cherchais simplement un énoncé vrai bien que sans lien apparent avec le sujet pour participer au jeu.

TiL on n'est pas sur le sujet TiL ici  

[Lancelot]

Quote

@Mathieu_D @Lancelot 

Alors ça tombe bien, il y a une vague de froid. On va voir si ça fait retomber le bidule. Une dizaine de jours après le confinement, celui-ci n'a pas l'air d'avoir eu d'effet spectaculaire, ce qui n'empêche pas les nuisibles de pousser à reconfiner bien sûr. Après tout nos voisins le font alors.

[L'affreux]

J'ai l'impression qu'un refroidissement ou un réchauffement climatique vous sortirait d'affaire. Mais ça n'arrivera pas si vous continuez à travailler depuis chez vous sans polluer.